Les sites ateliers de la Zone Atelier Bassin du Rhône constituent des unités spatiales cohérentes, représentatives de situations spécifiques du bassin, dans lesquels les chercheurs conduisent des recherches pluridisciplinaires permettant une approche concertée autour d'un même objet. Ce sont des lieux de production de science, de transfert de connaissance et de développement d’outils d’aide aux politiques publiques et à la gestion des milieux aquatiques.
La ZABR dispose de quatre sites ateliers :
Depuis la nouvelle programmation scientifique de la ZABR (2010 – 2013), la ZABR a décidé de fusionner le site « Y lyonnais » ; qui développe une approche sociale et historique des relations entre la ville et le fleuve, avec l’OTHU. Pour cette raison, le bilan d'activité du «Y lyonnais» 2006-2009 se trouve sur l'observatoire OTHU.
Depuis 2011, le conseil de direction de la ZABR, dans le souci de clarté avec ses partenaires opérationnels du Plan Rhône, a décidé d'intégrer le site Axe Rhône dans l'OHM. Pour cette raison, le bilan d'activité du site « Axe Rhône » se trouve sur l'OHM Vallée du Rhône.
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